一、学生学习知识掌握不牢

高三学生花21万补数学只考59分，可能是由于学生学习知识掌握不牢，没有充分理解和掌握数学知识，考试时缺乏准备，无法正确回答考题，从而导致考试成绩不理想。

二、学习缺乏系统性

高三学生花21万补数学只考59分，可能是由于学生学习缺乏系统性，学习数学知识时缺乏全面性和深入性，只学习一些表面的知识，而忽略了深层次的知识，从而导致考试成绩不理想。

三、没有及时纠正错误

高三学生花21万补数学只考59分，可能是由于学生没有及时纠正错误，学习数学时发现的错误没有及时纠正，从而导致考试成绩不理想。

四、教学质量不高

高三学生花21万补数学只考59分，可能是由于教学质量不高，教师没有给学生提供充分的学习指导，缺乏有效的教学方法，从而导致考试成绩不理想。

五、学习环境不理想

高三学生花21万补数学只考59分，可能是由于学习环境不理想，学生学习数学时，缺乏良好的学习环境，没有得到良好的指导，从而导致考试成绩不理想。

综上所述，高三学生花21万补数学只考59分，可能是由于学生学习知识掌握不牢、学习缺乏系统性、没有及时纠正错误、教学质量不高以及学习环境不理想等原因导致的。因此，在今后的学习过程中，学生应该加强知识学习，做到学以致用，提高学习质量，培养正确的学习习惯，提升学习效果，从而提高考试成绩。